En un reciente concepto emitido por el Consejo de Estado con radicado interno 2242 se ratifica que Unitrópico es sujeto de control por parte de la Contraloría Departamental de Casanare, ya que es una fundación mixta de segundo grado, descentralizada por servicios y cuyo socio mayoritario es la Gobernación de Casanare.
En el concepto emitido por el Consejo de Estado, se le hace un llamado de atención al Ministerio de Educación Nacional ya que permitió la creación de un claustro universitario no contemplado en la norma, puesto que según la Ley o es pública o es privada, más no mixta, además el concepto exhorta a dicho Ministerio a las gestiones pertinentes para la transformación de dicho claustro educativo.
Es de aclarar que la Contraloría Departamental de Casanare realizó auditoría a Unitrópico de las vigencias 2010 al 2014, y evidenciaron presuntos hallazgos fiscales por cerca de mil setecientos millones de pesos, lo que le generó una serie de criticas, entre las cuales estaba que el ente de control no tenía jurisdicción para hacer auditoría y que estaba cometiendo prevaricato; con el concepto emitido por el Consejo de Estado se legítima el control fiscal realizado por este ente de control en cabeza de la Contralora Carmenza Motta.
